Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms