Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnnc1P19123 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnnc1P19123 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms