Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rps6ka3P18654 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rps6ka3P18654 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms