Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Selenbp1P17563 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms