Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vpreb1P13372 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms