Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OtcP11725 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OtcP11725 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OtcP11725 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OtcP11725 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OtcP11725 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OtcP11725 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OtcP11725 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OtcP11725 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms