Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FlgP11088 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FlgP11088 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FlgP11088 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FlgP11088 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FlgP11088 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FlgP11088 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FlgP11088 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FlgP11088 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FlgP11088 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FlgP11088 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FlgP11088 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FlgP11088 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FlgP11088 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FlgP11088 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms