Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxb4P10284 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb4P10284 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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