Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Schip1P0DPB4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Schip1P0DPB4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms