Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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