Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
UbbP0CG49 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbbP0CG49 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms