Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb2P0C1T1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms