Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc9P09633 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc9P09633 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms