Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxa1P09022 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxa1P09022 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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