Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col3a1P08121 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col3a1P08121 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col3a1P08121 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col3a1P08121 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms