Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zfp1P08042 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp1P08042 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms