Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprcP06800 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprcP06800 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms