Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P06321 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P06321 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06321 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06321 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06321 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06321 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06321 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06321 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06321 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms