Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-Eb1P04230 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms