Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P04212 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P04212 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P04212 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P04212 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P04212 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P04212 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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