Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01822 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01822 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01822 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01822 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01822 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01822 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01822 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01822 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01822 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms