Protein–RNA interactions for Protein: P01783

Ig heavy chain V region MOPC 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01783 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01783 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01783 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01783 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01783 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01783 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01783 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01783 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01783 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01783 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01783 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01783 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01783 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01783 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01783 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms