Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01757 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01757 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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P01757 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01757 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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P01757 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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P01757 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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P01757 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01757 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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P01757 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01757 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01757 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01757 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms