Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01746 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01746 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01746 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01746 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01746 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01746 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01746 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01746 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01746 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01746 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms