Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01645 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01645 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01645 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01645 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01645 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01645 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P01645 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01645 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01645 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01645 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
P01645 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P01645 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
P01645 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
P01645 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01645 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01645 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
P01645 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms