Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hcn2O88703 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn2O88703 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms