Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BlmO88700 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
BlmO88700 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BlmO88700 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BlmO88700 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BlmO88700 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BlmO88700 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BlmO88700 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BlmO88700 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BlmO88700 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BlmO88700 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BlmO88700 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BlmO88700 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BlmO88700 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BlmO88700 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BlmO88700 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BlmO88700 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BlmO88700 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms