Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnnt1O88346 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnnt1O88346 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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