Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nid2O88322 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nid2O88322 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nid2O88322 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nid2O88322 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms