Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtssO70370 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtssO70370 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtssO70370 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtssO70370 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CtssO70370 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtssO70370 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtssO70370 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms