Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rpl35aO55142 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl35aO55142 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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