Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mmp10O55123 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms