Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr1O55100 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr1O55100 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms