Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copb2O55029 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copb2O55029 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Copb2O55029 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms