Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LatO54957 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LatO54957 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LatO54957 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LatO54957 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LatO54957 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LatO54957 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LatO54957 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LatO54957 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LatO54957 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LatO54957 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms