Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf12O54907 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsf12O54907 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfsf12O54907 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms