Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DffaO54786 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DffaO54786 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DffaO54786 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DffaO54786 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DffaO54786 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DffaO54786 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DffaO54786 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms