Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FxnO35943 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FxnO35943 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FxnO35943 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FxnO35943 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FxnO35943 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FxnO35943 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FxnO35943 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms