Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Clk2O35491 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clk2O35491 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clk2O35491 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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