Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sema6aO35464 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sema6aO35464 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms