Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccrl2O35457 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms