Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TnxbO35452 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms