Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ppef2O35385 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppef2O35385 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms