Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d1bO35324 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sh2d1bO35324 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh2d1bO35324 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms