Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Nedd9O35177 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Nedd9O35177 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Nedd9O35177 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Nedd9O35177 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nedd9O35177 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Nedd9O35177 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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