Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pitx3O35160 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pitx3O35160 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms