Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Eftud2O08810 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Eftud2O08810 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms