Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcshO08795 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcshO08795 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrkcshO08795 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrkcshO08795 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrkcshO08795 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcshO08795 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkcshO08795 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcshO08795 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcshO08795 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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