Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AlyrefO08583 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AlyrefO08583 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms