Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Efna4O08542 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms